* 2016年12月底，長期資助 CyanogenMod 專案的 Cyanogen 公司宣布2017停止資助，關閉所有伺服器。
* CyanogenMod 的志工開發社群成立新專案，改名為 Lineage OS (官網)，將會以 CyanogenMod 的程式碼為基礎繼續開發。－－這正說明了本站一再強調的事：開源軟體的優點是，不會因為一家公司倒閉或不再支持研發就消失。
本文雖是針對 CyanogenMod 而寫，但也適用於 Android。
CyanogenMod 是基於 Android 修改而來的一種手機作業系統，
特色一：將 Google 內建於 Android 的程式改成使用者可自行選擇要不要安裝，從而讓使用者取回對手機的完整掌控權。
特色二：改進 Android 的運行效率，可以跑得比 Android 快又省記憶體。
關於本文的前提問題：為什麼要將 Android 手機｢刷機」改用 CyanogenMod 這個作業系統？簡單說：為了安全、隱私。詳見這篇（手機不該 Root/越獄/刷機的理由有很多； 但 「安全」 絕對不是其中之一）
正文
Q1: 全機加密的功能是什麼？
若只設定｢鎖定螢幕密碼」而沒有設定全機加密，只要把手機接上電腦，或者重開機進入 Recovery 模式，便可輕易繞過螢幕鎖定而直接讀取內容（方法）。
設定全機加密後，只要手機處於關機狀態（或按下重新開機），不輸入正確密碼就無法進入系統，並且，就算把手機插上USB線接到其他電腦，也無法讀取內容。
Q2: 螢幕鎖定的功能是什麼？
就算設定了全機加密，但如果手機遺失時是已開機狀態，對資料的保護就要依賴｢鎖定螢幕密碼｣。
螢幕鎖定密碼的注意事項，請見這篇的1.4, 1.5。
Q3: 如何在 CyanogenMod 13 執行全機加密？
做法：設定 > 安全性 > 對手機進行加密
需要手機是充飽電的情況才能開始，並且建議全程插著電。
如果你的手機還沒有設定｢鎖定畫面｣密碼，這裡會要你設定新密碼。
如果你已經設定過｢鎖定畫面｣密碼才來做全機加密，那全機加密的密碼預設等於鎖定畫面密碼。輸入正確之後就開始加密。
這密碼要記牢，因為一旦忘記，雖然不是完全沒救，但會很麻煩。
Q4. 我想要讓全機加密的密碼跟鎖定螢幕密碼不同？
這是做得到的，但做完後也伴隨著一些隱藏的麻煩。
做法：(1) 安裝 Cryptfs Password 這個 APP，執行它。
(2) 要求輸入現在的密碼：由於第一次加密時使用圖形密碼，如果是 3×3 的密碼，把它想像成像電話撥號盤那樣排列：
123
456
789
依照圖形密碼經過的點的順序來輸入數字：假設我們在加密時設定了從右上畫到左下的一條線當密碼，那麼它實際上就等於 357。假設是左上畫到右下，那等於159。
(3) 然後輸入你的新密碼。完成。
(4) 修改完全機加密密碼後，它現在跟｢鎖定螢幕｣密碼不一樣了。這也是要注意的地方！：如果你之後把作業系統清空 (wipe) 後重新安裝，且在新安裝的作業系統上又設定了｢鎖定螢幕密碼」，那麼重新開機之前一定要再做上面(1)~(3)的步驟一次，把全機加密密碼改回你想要的。不然會發生重新開機後進不了系統的慘劇。（見Q4）
Q5: 要怎麼處理上一點最後面的慘劇？
這個慘劇之所以發生，是因為系統在第一次設定鎖定畫面密碼時（或者後來修改密碼類型時），它會一併修改磁碟加密的密碼類型，但沒有修改磁碟加密密碼。如果你新的鎖定畫面密碼是圖形，但磁碟加密卻是文字，那就沒辦法輸入了。
據說在 CyanogenMod 10、11版可以這樣解決，而不需要格式化。但這方法在CM 13我還沒找到成功的案例。
一定可行的處理方法是：進 Recovery 模式，格式化（把磁碟加密的 header 洗掉）後重新安裝。如果平常有備份 Apps，這方法不用一小時就可以解決。
Q6: 全機加密後，進入 Recovery 模式無法讀取儲存裝置？或者無法使用 Recovery 來升級系統？
這是因為你的 Recovery 版本不支援全機加密的解碼。目前幾個常用且有人維護的 Recovery 當中，CyanogenMod 自己的 Recovery 還不支援全機加密。TeamWin – TWRP 3.0.2.0以下的版本也不支援全機加密。
但是TeamWin – TWRP 3.0.2.4則確定支援。所以，做法：
(1) 請到這裡找自己手機型號，下載 TWRP 最新的 Recovery Image。
(2) 下載並安裝 Android Studio（手機程式開發工具），這步驟目的是要取得安裝完成後的 “platform-tools” 這個資料夾裡面的幾個程式。
如果是 Windows，這資料夾在 C:\users\你的windows登入名稱\AppData\Local\Android\android-sdk\（AppData 這資料夾預設是隱藏的，要在檔案夾視窗的｢選項 > 檢視｣裡把｢隱藏保護的作業系統檔案」取消，才看的到）。
* 網路上也有一些人直接提供這些檔案，不過為了安全，還是自己下載官方版本的 Android Studio來安裝比較好。
* 安裝完成後，可以把 “platform-tools” 這資料夾複製到你想存放的地方，然後把 Android Studio 解除安裝。
(3) 將手機透過USB線接上電腦，然後進入 bootloader 模式（搜尋關鍵字：如何進入 手機 bootloader）
(4) 在 Windows 打開命令提示字元，並切換到你存 “platform-tools” 的目錄。假設存在C槽一進去（沒有任何目錄），指令是
cd c:\platform-tools //按 enter
(5) 在命令列輸入 fastboot flash recovery xxxx.img
便會安裝剛下載的 Recovery。（xxx填入你下載的檔名，含完整路徑；為了方便，可以存在 “platform-tools” 目錄，就不用輸入路徑名稱）
(6) 下次開啟 Recovery 模式，應該就可以輸入文字或數字的密碼了。
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